Dans les profondeurs de l'océan, Lupin est à la recherche d'un trésor dans l'espoir de conquérir Fujiko. Alors que Zenigata les poursuit sur terre et sur mer, des personnes aux alentours du gang commencent à disparaître mystérieusement. Le brouillard se dissipe et Mamo Kyosuke apparaît dans un éclat de lumière ; il affirme venir du futur et chercher à se venger de Lupin III pour ce que Lupin XIII

Dans les profondeurs de l'océan, Lupin est à la recherche d'un trésor dans l'espoir de conquérir Fujiko. Alors que Zenigata les poursuit sur terre et sur mer, des personnes aux alentours du gang commencent à disparaître mystérieusement. Le brouillard se dissipe et Mamo Kyosuke apparaît dans un éclat de lumière ; il affirme venir du futur et chercher à se venger de Lupin III pour ce que Lupin XIII lui a fait subir. Mamo projette Lupin, Jigen, Goemon et Zenigata 500 ans dans le passé ; alors que deux factions belligérantes s'affrontent pour un sanctuaire légendaire dédié au voyage temporel, Lupin doit trouver un moyen de survivre au passé pour assurer son futur. Ce film est un remake de l'épisode 13 de la série originale de Lupin III.