Dans un futur lointain, la dépendance de l'humanité aux énergies fossiles mènera à leur épuisement complet, une crise énergétique sans précédent. Par esprit de vengeance et par peur, l'humanité se tourna vers une source d'énergie alternative : l'énergie solaire. Différentes nations s'unirent pour former trois grandes factions : l'Union des nations libres et de l'énergie solaire, l'Union européenne

Dans un futur lointain, la dépendance de l'humanité aux énergies fossiles mènera à leur épuisement complet, une crise énergétique sans précédent. Par esprit de vengeance et par peur, l'humanité se tourna vers une source d'énergie alternative : l'énergie solaire. Différentes nations s'unirent pour former trois grandes factions : l'Union des nations libres et de l'énergie solaire, l'Union européenne avancée, et la Ligue de réforme humaine. Chacun de ces secteurs a accès à un générateur d'énergie solaire, leur fournissant une énergie illimitée. En conséquence, les pays autrefois dépendants de la vente de combustibles fossiles sont désormais plongés dans la pauvreté, menant à des années de guerre et de conflits internes pour le contrôle de l'énergie solaire. Au milieu de ce chaos, une organisation paramilitaire inconnue apparut, s'identifiant comme « Celestial Being », aspirant à mettre fin à toute guerre par une intervention armée, utilisant des Mobile Suits mystérieux et technologiquement avancés connus sous le nom de Gundams. Mobile Suit Gundam 00 suit l'histoire des Gundam Meisters de Celestial Being : Setsuna F. Seiei, Lockon Stratos, Allelujah Haptism et Tieria Erde. Ces quatre plongeurs s'engagent dans la bataille dévastatrice entre les trois superpuissances pour accomplir leur objectif de changer le monde.