Dès leur première rencontre, Masaru Daimon, combattant de rue invaincu, et Agumon, un Digimon renégat, deviennent amis de la manière la plus naturelle pour ce duo à la tête dure : en se battant à cœur joie. L'« équipe ultime » autoproclamée est recrutée par une organisation gouvernementale secrète appelée la Digital Accident Tactics Squad, ou DATS, qui a été témoin du spectacle incroyable d'un hum

Dès leur première rencontre, Masaru Daimon, combattant de rue invaincu, et Agumon, un Digimon renégat, deviennent amis de la manière la plus naturelle pour ce duo à la tête dure : en se battant à cœur joie. L'« équipe ultime » autoproclamée est recrutée par une organisation gouvernementale secrète appelée la Digital Accident Tactics Squad, ou DATS, qui a été témoin du spectacle incroyable d'un humain combattant coup pour coup avec un Digimon. Leur objectif principal est d'enquêter sur les problèmes mystérieux causés par l'entrée de Digimon dans le monde réel, et le monde est actuellement en pleine crise avec des Digimon apparaissant à un rythme sans précédent. Au cours de diverses missions avec la DATS, Masaru et Agumon deviennent les collègues du prodige adolescent Touma Norstein et de son partenaire Digimon Gaomon, ainsi que de la bienveillante Yoshino « Yoshi » Fujieda et de son partenaire Digimon Lalamon. Alors que le groupe continue d'enquêter sur l'augmentation rapide des Digimon dans leur monde, une vérité plus sombre commence à faire surface.