Le portail vers le Monde Numérique est clos depuis trois ans. Taichi Yagami et ses amis ont depuis tourné la page, et maintenant qu'il est en deuxième année de lycée, il est temps pour lui de grandir. Alors que tout le monde sait ce qu'il veut faire de sa vie, Taichi reste incertain. Pendant ce temps, le groupe s'éloigne de plus en plus en suivant ses propres chemins. Un jour, un Digimon insectoï

Le portail vers le Monde Numérique est clos depuis trois ans. Taichi Yagami et ses amis ont depuis tourné la page, et maintenant qu'il est en deuxième année de lycée, il est temps pour lui de grandir. Alors que tout le monde sait ce qu'il veut faire de sa vie, Taichi reste incertain. Pendant ce temps, le groupe s'éloigne de plus en plus en suivant ses propres chemins. Un jour, un Digimon insectoïde renégat nommé Kuwagamon se matérialise et perturbe l'électronique dans toute la ville. Taichi le poursuit imprudemment et se retrouve acculé par le Digimon qui attaque. Soudain, le Digivice qu'il porte toujours — un appareil numérique qui sert à diverses fins, y compris aider son Digimon partenaire à évoluer — s'illumine, et Agumon apparaît. Les deux parviennent à vaincre Kuwagamon, mais pourquoi le Digimon a-t-il traversé dans ce monde en premier lieu ? Que se passe-t-il dans le Monde Numérique, et comment cela implique-t-il exactement Meiko Mochizuki, la nouvelle étudiante transférée dans la classe de Taichi ?