Synopsis

Suite à une guerre catastrophique contre une race de géants appelés les Zentradi, l'humanité s'est échappée vers le centre de la galaxie à bord d'une flotte de vaisseaux coloniaux nommée Macross Frontier. Alors que la menace extraterrestre s'éloigne de plus en plus, la vie sur Macross Frontier suit son cours. En l'an 2059, un jeune stagiaire pilote de mecha nommé Alto Saotome et ses collègues se préparent à réaliser une chorégraphie d'accompagnement pour la célèbre chanteuse Sheryl Nome, venue à Macross Frontier pour un concert. Pendant la performance, une espèce extraterrestre biomécanique connue sous le nom de Vajra fait une apparition soudaine, traversant le périmètre défensif entourant le vaisseau et s'écrasant près du lieu du concert, plongeant toute la ville dans le chaos. Alors que les spectateurs évacuent, une jeune fille nommée Ranka Lee est oubliée et se retrouve prise pour cible par les Vajra, mais elle est sauvée in extremis par Alto. Suite à ces événements, le programme Strategic Military Services note l'habileté d'Alto au combat, ce qui conduit à son recrutement pour combattre la nouvelle menace extraterrestre.