Alors que la Quatrième Guerre du Saint Graal fait rage sans vainqueur clair en vue, les Servants restants et leurs Maîtres sont convoqués par le superviseur de l'Église, Risei Kotomine, afin de s'unir et de faire face à une menace imminente qui pourrait défaire la Guerre du Saint Graal et entraîner la destruction de la ville de Fuyuki. La trêve précaire s'effondre rapidement lorsque les Maîtres dé

Alors que la Quatrième Guerre du Saint Graal fait rage sans vainqueur clair en vue, les Servants restants et leurs Maîtres sont convoqués par le superviseur de l'Église, Risei Kotomine, afin de s'unir et de faire face à une menace imminente qui pourrait défaire la Guerre du Saint Graal et entraîner la destruction de la ville de Fuyuki. La trêve précaire s'effondre rapidement lorsque les Maîtres démontrent qu'ils feront tout ce qui est en leur pouvoir, aussi méprisable soit-il, pour gagner. Des graines de doute sont semées entre Kiritsugu Emiya et Saber, son Servant, alors que leurs idéologies conflictuelles sur l'héroïsme et la chevalerie s'affrontent. Pendant ce temps, un lien inquiétant se forme entre Kirei Kotomine, qui cherche toujours à trouver un but à sa vie, et l'un des Servants restants. Alors que le compte à rebours jusqu'à la fin de la guerre atteint zéro, le coût de la victoire commence à brouiller la frontière entre la victoire et la défaite.