Un autre bel été s'achève pour Illyasviel von Einzbern. Loin de ses devoirs de magical girl, elle profite de ses vacances après avoir collecté les Class Cards avec sa meilleure amie, Miyu Edelfelt. Cependant, sa pause prend fin brusquement lorsqu'elle et Miyu sont enlevées par Rin Toosaka et Luviagelita Edelfelt, alors qu'elles sont sorties avec leurs amies. Les magical girls apprennent que leur

Un autre bel été s'achève pour Illyasviel von Einzbern. Loin de ses devoirs de magical girl, elle profite de ses vacances après avoir collecté les Class Cards avec sa meilleure amie, Miyu Edelfelt. Cependant, sa pause prend fin brusquement lorsqu'elle et Miyu sont enlevées par Rin Toosaka et Luviagelita Edelfelt, alors qu'elles sont sorties avec leurs amies. Les magical girls apprennent que leur travail est loin d'être terminé, car la Tour de l'Horloge les informe que le mana incontrôlable, que l'on croyait scellé, continue de se disperser dans la ville de Fuyuki. Après s'être rendues au point d'origine du mana incontrôlable, Illya et Miyu sont chargées de résoudre cette anomalie. Mais après avoir lancé leur sort, Illyasviel découvre qu'elle s'est scindée en deux personnes ! Alors que cette nouvelle forme mystérieuse s'enfuit, elle ne peut que se demander ce qui résultera de l'existence de son double, semant le chaos dans la ville insouciante ?