Natsume Yuujinchou San suit Takashi Natsume, un garçon capable de voir les yōkai. Natsume et son garde du corps Madara, surnommé Nyanko-sensei, poursuivent leur quête pour libérer les yōkai de leurs contrats inscrits dans le « Livre des Amis ». Natsume accepte sa capacité à voir les yōkai et cesse de la considérer comme une malédiction. À mesure qu'il passe du temps avec ses amis humains et yōkai

Natsume Yuujinchou San suit Takashi Natsume, un garçon capable de voir les yōkai. Natsume et son garde du corps Madara, surnommé Nyanko-sensei, poursuivent leur quête pour libérer les yōkai de leurs contrats inscrits dans le « Livre des Amis ». Natsume accepte sa capacité à voir les yōkai et cesse de la considérer comme une malédiction. À mesure qu'il passe du temps avec ses amis humains et yōkai, il réalise combien il les apprécie tous et décide qu'il n'a pas à choisir entre le monde des esprits et le monde humain pour être heureux.