L'étudiant au lycée et gamer Suigin Riku fréquente la prestigieuse Académie Privée Shinryou, une école réservée à l'élite et aux enfants fortunés. Mais riche ou aisé ne sont pas des termes qui décrivent Suigin ; en réalité, il est extrêmement pauvre et doit cumuler de nombreux petits boulots pour payer ses frais de scolarité. Lors d'un de ces travaux, il plonge dans une piscine pour sauver son cha

L'étudiant au lycée et gamer Suigin Riku fréquente la prestigieuse Académie Privée Shinryou, une école réservée à l'élite et aux enfants fortunés. Mais riche ou aisé ne sont pas des termes qui décrivent Suigin ; en réalité, il est extrêmement pauvre et doit cumuler de nombreux petits boulots pour payer ses frais de scolarité. Lors d'un de ces travaux, il plonge dans une piscine pour sauver son chat, bien conscient qu'il ne sait pas nager. Heureusement, il est sauvé par Rei Riku, la belle et populaire fille d'un développeur de jeux, dont il tombe amoureux. Il est également attiré par une autre fille : une nouvelle amie qu'il rencontre dans Dungeon Century, son RPG en ligne préféré. Mais lorsque le jeu doit fermer, il sait que ses aventures avec elle prendront bientôt fin. Cependant, le lendemain de la fermeture du jeu, il découvre que Rei et la fille rencontrée en ligne ne font qu'une. Peu de temps après, Rei offre à Suigin un nouveau jeu destiné à remplacer Dungeon Century : un jeu d'exploration de tombes appelé Grave Buster. Mais lorsque Rei est soudainement kidnappée, Suigin est aspiré à l'intérieur de Grave Buster pour la sauver. Gin no Guardian suit Suigin alors qu'il traverse Grave Buster pour sauver Rei, tout en découvrant les secrets cachés dans le jeu.