Le sergent Keroro et ses quatre subordonnés sont venus de la planète Keron sur Terre dans le but de la conquérir. Cependant, sans prévenir, ils ont commencé à apprécier la vie sur Terre. Keroro était censé rester avec Hitana pour avoir une chance de conquérir la Terre, mais il s'est lié d'amitié avec le fils de Hinata, Fuyuki. Aujourd'hui, comme d'habitude, Keroro part acheter sa maquette Gundam

Le sergent Keroro et ses quatre subordonnés sont venus de la planète Keron sur Terre dans le but de la conquérir. Cependant, sans prévenir, ils ont commencé à apprécier la vie sur Terre. Keroro était censé rester avec Hitana pour avoir une chance de conquérir la Terre, mais il s'est lié d'amitié avec le fils de Hinata, Fuyuki. Aujourd'hui, comme d'habitude, Keroro part acheter sa maquette Gundam préférée avec Fuyuki. Sur le chemin du retour, ils découvrent un petit sanctuaire et y entrent. Là, ils trouvent un vase et le cassent par accident. Dès le lendemain, des choses étranges se produisent dans toute la ville et la panique s'installe. À l'intérieur du vase était scellé Kiruru, l'arme ultime ancestrale de Keron. À ce moment-là, Mirara, qui détient le secret de Kiruru, apparaît et leur révèle la seule méthode pour sauver la Terre. Cependant...