De retour à Konoha, les jeunes ninjas célèbrent leur victoire sur un groupe de prétendus membres de l'Akatsuki. Naruto Uzumaki et Sakura Haruno, cependant, ressentent différemment. Naruto est jaloux des familles de ses camarades qui les félicitent, souhaitant la présence de ses propres parents. Sakura, quant à elle, est en colère contre ses parents embarrassants et préférerait n'avoir aucun parent

De retour à Konoha, les jeunes ninjas célèbrent leur victoire sur un groupe de prétendus membres de l'Akatsuki. Naruto Uzumaki et Sakura Haruno, cependant, ressentent différemment. Naruto est jaloux des familles de ses camarades qui les félicitent, souhaitant la présence de ses propres parents. Sakura, quant à elle, est en colère contre ses parents embarrassants et préférerait n'avoir aucun parent. Les deux s'affrontent sur leurs idéaux opposés, mais sont confrontés à un problème plus urgent lorsque le mystérieux Madara Uchiha apparaît soudainement et les transporte dans un monde alternatif. Dans ce monde, les parents de Sakura sont considérés comme des héros — car ils ont donné leur vie pour protéger Konoha lors de l'attaque du Kyûbi il y a 10 ans. Par conséquent, les parents de Naruto, Minato Namikaze et Kushina Uzumaki, sont vivants et en bonne santé. Incapables de retourner chez eux ou de retrouver le mystérieux Madara, Naruto et Sakura restent dans ce nouveau monde et profitent des changements dont ils ont toujours rêvé. Tout semble aller pour le mieux pour les deux ninjas, jusqu'à ce qu'une menace inattendue surgisse, poussant Naruto et Sakura non seulement à se battre pour le Konoha de ce monde alternatif, mais aussi à trouver un moyen de retourner dans le leur.