Synopsis

Alors qu'ils prennent un ferry pour l'Académie Fuuka, les nouveaux élèves Mai Tokiha et son jeune frère maladif, Takumi, aperçoivent une fille à la dérive sur l'eau. Peu après l'avoir ramenée à bord, le ferry est attaqué par un assaillant qui invoque un monstre mécanique. Malgré ses blessures encore récentes, Mikoto Minagi repousse le monstre à l'aide d'une épée surnaturelle. Mai découvre bientôt que Mikoto est une autre élève de l'Académie Fuuka dotée de pouvoirs appelés HiME (Highly-advanced Materializing Equipment). Les élèves féminines possédant le pouvoir HiME sont chargées de défendre l'académie et la ville locale contre les "Orphelins" monstrueux. Après plusieurs incidents à l'école impliquant des combats contre ces créatures mystérieuses, Mai apprend qu'elle est elle-même une HiME et qu'elle est capable d'invoquer un Enfant, une créature mécanique capable d'une grande utilité et puissance de feu. Désormais accablée de nouvelles responsabilités, Mai rejoint 12 autres HiME pour protéger l'école d'une menace qu'elles connaissent peu, tout en protégeant leurs proches.