Kaori Sasaki, membre du club d'astronomie de l'Académie Uchihama, avoue ses sentiments à Sou Akiyama, mais le soir même, elle meurt dans un tragique accident de la route. Ses amis et camarades du club pleurent sa mort dans un hôpital local. Pourtant, elle se présente à l'école le lendemain, et personne ne semble remarquer quoi que ce soit d'étrange. La journée se termine sans incidents particulie

Kaori Sasaki, membre du club d'astronomie de l'Académie Uchihama, avoue ses sentiments à Sou Akiyama, mais le soir même, elle meurt dans un tragique accident de la route. Ses amis et camarades du club pleurent sa mort dans un hôpital local. Pourtant, elle se présente à l'école le lendemain, et personne ne semble remarquer quoi que ce soit d'étrange. La journée se termine sans incidents particuliers, et le groupe d'amis planifie le festival culturel à venir. Soudain, la pièce est secouée par un tremblement de terre surnaturel. Tout le monde se disperse pour enquêter, à l'exception de Nagisa Hanamiya, qui reste en retrait. Alors que les autres partent, Nagisa remarque que l'étrange cube, semblable à une relique, avec lequel elle jouait, commence à émettre une étrange lumière bleue. Pendant ce temps, Sou découvre une jeune fille inconsciente et nue gisant dans une mare d'eau. Ushinawareta Mirai wo Motomete suit les aventures de plus en plus bizarres du club d'astronomie, allant de la gestion de fantômes à l'apaisement des tensions entre les clubs d'étudiants. Tout cela, tout en découvrant les circonstances entourant l'apparition soudaine d'une nouvelle élève transférée.