Isami Hanaoka n'est qu'une élève de cinquième année qui se trouve être une descendante du Shinsengumi. Avec ses camarades de classe et descendants, Soushi Yukimi et Toshi Tsukikage, elle découvre dans le sous-sol de sa maison d'étranges artefacts laissés par leurs ancêtres ainsi qu'un message les exhortant à « combattre la maléfique organisation Kurotengu. »