Synopsis

À la recherche du grand amour, Kanako Miyamae intègre le lycée catholique Ame no Kisaki, inspirée par la façon dont ses parents sont tombés amoureux dans cet établissement. Il y a cependant une différence de taille : comme les hommes provoquent chez Kanako une éruption d'urticaire, elle est en réalité venue dans cette école exclusivement féminine pour trouver une partenaire du même sexe. Lorsqu'elle rencontre la magnifique Mariya Shidou, Kanako pense avoir trouvé l'élue de son cœur. Pourtant, Mariya cache bien des secrets : il s'avère que le premier amour de Kanako est en réalité un garçon qui s'habille en fille. Mariya menace de révéler les intentions peu orthodoxes de Kanako si elle ne garde pas son vrai genre secret. Pour couronner le tout, il remplace également sa colocataire d'origine afin de pouvoir la surveiller de près. Maria†Holic suit Kanako dans sa quête amoureuse dans les endroits les plus improbables et sa recherche de la fille de ses rêves… si elle parvient à survivre en tant que colocataire de Mariya !