Synopsis

En l'an 2029, la ville de Niihama est devenue une métropole technologiquement avancée. Grâce aux grandes améliorations en cybernétique, ses citoyens peuvent remplacer leurs membres par des pièces robotiques. Le monde est désormais plus interconnecté que jamais, et la Section 9 de la Sécurité Publique de la ville est chargée de lutter contre la corruption, le terrorisme et d'autres menaces dangereuses suite à cette transition vers la mondialisation. La Major Motoko Kusanagi, volontaire et déterminée, dirige la Section 9 dans une affaire impliquant un mystérieux hacker connu uniquement sous le nom de « Puppet Master », qui laisse derrière lui un sillage de victimes privées de leurs souvenirs. Comme beaucoup dans ce monde futuriste, le corps du Puppet Master est presque entièrement robotique, ce qui lui confère une puissance incroyable. Alors que Motoko et ses subordonnés suivent la piste de ce criminel énigmatique, d'autres parties — y compris la Section 6 — commencent à s'impliquer, la forçant à confronter la nature extrêmement compliquée de l'affaire. S'interrogeant sur diverses questions philosophiques, telles que le sens de sa propre vie, Motoko réalise bientôt que celui qui lui apportera ces réponses n'est autre que le Puppet Master lui-même.