Synopsis

Les jumeaux Megumu Kobayashi et Mitsuru Kobayashi fréquentent des établissements différents, l'un pour filles et l'autre pour garçons. Un jour, lassés d'être entourés de personnes du même sexe, ils décident d'échanger leurs places. Si leur subterfuge semble passer inaperçu pendant un temps, la situation se complique lorsque la possibilité de romance apparaît. Kobayashi ga Kawai sugite Tsurai!! débute lorsqu'une confession sincère de Megumu mène à un baiser partagé avec le senpai Aoi Sanada, alors qu'il est déguisé en son frère. Cela amène Aoi, qui n'a jamais été doué avec les filles, à se demander s'il n'aime pas plutôt les garçons. De même, Mitsuru découvre la fière reine de l'école, Azusa Tokugawa, dans une position vulnérable qui fait battre son cœur dans ses (ses) bras. Les deux couples sont fous d'amour, mais le secret de l'identité échangée des jumeaux n'a pas encore été révélé...