Après la première guerre entre l'humanité et une espèce extraterrestre connue sous le nom de Vers, la Terre n'est plus que l'ombre d'elle-même, de nombreux continents étant submergés et d'innombrables vies humaines perdues. Lorsque les Vers reviennent, presque tous les citoyens valides sont mobilisés pour rejoindre le combat désespéré. Otoha Sakurano, Eika Ichijou et Karen Sonomiya sont trois jeun

Après la première guerre entre l'humanité et une espèce extraterrestre connue sous le nom de Vers, la Terre n'est plus que l'ombre d'elle-même, de nombreux continents étant submergés et d'innombrables vies humaines perdues. Lorsque les Vers reviennent, presque tous les citoyens valides sont mobilisés pour rejoindre le combat désespéré. Otoha Sakurano, Eika Ichijou et Karen Sonomiya sont trois jeunes filles chargées de former une unité d'élite de « Sonic Divers » : des soldats utilisant une technologie innovante d'exosquelettes pour améliorer leur combat. Lorsque leur transport furtif est violemment pris en embuscade, les filles doivent s'équiper et prouver que leur unité a ce qu'il faut pour protéger l'humanité.