Shiki Tōno se réveille dans une chambre d'hôpital avec la capacité de voir des lignes invisibles. Ces fils fins, qui composent toute matière dans Shingetsutan, détruisent instantanément un objet lorsqu'ils sont coupés. Shiki découvre que s'il trace les lignes d'un objet, sa destruction s'ensuit bientôt. Tout en gardant sa vision surnaturelle secrète, Shiki s'efforce de vivre sa vie de lycéen en pa

Shiki Tōno se réveille dans une chambre d'hôpital avec la capacité de voir des lignes invisibles. Ces fils fins, qui composent toute matière dans Shingetsutan, détruisent instantanément un objet lorsqu'ils sont coupés. Shiki découvre que s'il trace les lignes d'un objet, sa destruction s'ensuit bientôt. Tout en gardant sa vision surnaturelle secrète, Shiki s'efforce de vivre sa vie de lycéen en paix. Cependant, cette paix est de courte durée lorsque Shiki rencontre une femme mystérieuse aux yeux rouge vif sur le chemin du retour de l'école. Suite à un accès psychotique soudain, il semble tuer la femme et s'évanouit peu après. Comme si les choses ne pouvaient pas empirer, Shiki est assailli par une paire de chiens démoniaques le lendemain — face à une mort certaine, Shiki est sauvé par l'arrivée opportune de la même femme que la veille. Elle se présente comme Arcueid Brunestud, une princesse vampire. Décidant de faire équipe, Shiki et Arcueid se lancent dans un voyage pour découvrir la vérité derrière leur lignée et la récente série de meurtres dans la ville.